به منظور طراحی برج تقطیر اتمسفریک در نظر گرفتن پارامترهای زیر بسیار ضروری می باشد:

• خصوصیات خوراک ورودی: خصوصیاتی از قبیل محتوای گوگرد، ویسکوزیته، شاخص API و… از مواردی هستند که به مشخص شدن تجهیزات مورد نیاز و شرایط عملیاتی کمک می کند.
• ارتفاع و قطر برج: ارتفاع برج باید به اندازه ای باشد که تماس بین فاز بخار و مایع تا حد امکان به صورت کامل انجام شود. به طور معمول بر اساس سرعت بخار موجود در برج، اندازه ی قطر تعیین می گردد.
• نوع سینی ها: بر اساس افت فشاری و مقدار جداسازی که قرار است انجام گیرد، سینی برج انتخاب می شود. معمولا از یکی از سینی های Sieve Trays، Valve Trays یا Bubble Cap استفاده می شود.
• میزان رفلاکس: جریان رفلاکس برای افزایش جداسازی به کارگرفته می شود. یکی از پارامترهایی که سهم بهسزایی بر روی ویژگی های محصول نهایی از برج دارد، میزان جریان رفلاکس می باشد.
• پارامترهای عملیاتی برج: دما، فشار و دبی از مهم ترین پارامترهای عملیاتی می‌باشند. طراحی برج باید به گونه ای باشد تا پروفایل دما و فشار در طول برج حفظ شود تا جداسازی به خوبی انجام شود.
• بار حرارتی ریبویلر و کندانسور: فاز مایع و بخار بایستی در طول برج به خوبی فراهم شوند تا برج عملکرد مطلوب خود را داشته باشد. بار حرارتی ریبویلر و کندانسور باید به گونه ای تنظیم شود تا علاوه بر تامین فاز بخار و مایع، از نظر انرژی نیز اتلافی صورت نگیرد.